زیرواحد ۳۰اس ریبوزوم پروکاریوتی

زیرواحد کوچک ریبوزوم پروکاریوتی یا زیرواحد ۳۰اِس (به انگلیسی: Prokaryotic small ribosomal subunit) زیرواحد کوچک‌تر ریبوزوم ۷۰اِس است که در پروکاریوت‌ها یافت می‌شود. این زیرواحد، مجموعه‌ای از آران‌ای ریبوزومی (rRNA) ۱۶اِس و ۱۹ پروتئین است.^[۲] این مجموعه، در اتصال آران‌ای حامل (tRNA) به آران‌ای پیام‌رسان (mRNA) نقش دارد.^[۳] زیرواحد کوچک، مسئول اتصال و خواندن mRNA در طول ترجمه است. این زیرواحد، همراه rRNA و پروتئین‌های خود، با زیرواحد بزرگ ۵۰اِس، کمپلکس می‌شوند تا ریبوزوم پروکاریوتی کامل ۷۰اِس را در سلول‌های پروکاریوتی تشکیل دهند. ریبوزوم ۷۰اِس، سپس برای ترجمهٔ mRNA به پروتئین استفاده می‌شود. زیرواحد ۳۰اِس، بخشی جدایی‌ناپذیر از ترجمه mRNA است که سه فاکتور شروع پروکاریوتی IF-1، IF-2 و IF-3 را به یکدیگر، متصل می‌کند.^[۴]

ساختار

زیرواحد کوچک ریبوزومی، از آران‌ای ریبوزومی ۱۶اِس و ۱۹ پروتئین کامل تشکیل شده‌است.^[۵] همچنین یک زنجیره پلی‌پپتیدی وجود دارد که از ۲۶ آمینو اسید تشکیل شده‌است.^[۶] به‌طور معمول، rRNA با "H#" برچسب‌گذاری می‌شود تا عدد مارپیچ را در تصاویر، با وضوح بالا نشان دهد. پروتئین‌ها با علامت "S#" مشخص می‌شوند که پپتیدهای مختلف درگیر در تثبیت rRNA هستند. اِس۱۱ و اِچ۴۵، در نزدیکی محل اتصال Shine-Dalgarno قرار دارند که همچنین نزدیک محل اتصال IF-3 است. پروتئین‌های اِس۳، اِس۴، اِس۵ و اِس۱۲ به همراه اِچ۱۸، در نزدیکی کانالی قرار دارند که mRNA در زیرواحد ۳۰اِس حضور دارد.^[۷]

مهار

زیرواحد ۳۰اِس، هدف آنتی‌بیوتیک‌هایی مانند تتراسایکلین و جنتامایسین است.^[۸] این آنتی‌بیوتیک‌ها به‌طور خاص، ریبوزوم‌های پروکاریوتی را هدف قرار می‌دهند، از این رو در درمان عفونت‌های باکتریایی در یوکاریوت‌ها مفید هستند. تتراسایکلین با اِچ۲۷ در زیرواحد کوچک و همچنین اتصال به A-site در زیر واحد بزرگ تعامل دارد.^[۸] پورومایسین یک مهارکنندهٔ ترجمهٔ ریبوزومی است.^[۹] پاکتامایسین، اتصال را در ناحیهٔ اتصال شاین-دالگارنو در زیرواحد کوچک، قطع می‌کند و در نتیجه، فعالیت را مختل می‌کند. هیگرومایسین بی همچنین با اِچ۴۴ تعامل می‌کند و حرکت و جابه‌جایی را که در طول بیوسنتز پروتئین ضروری است، مهار می‌کند.^[۸]

جستارهای وابسته

منابع

↑ Schluenzen, Frank; Tocilj, Ante; Zarivach, Raz; Harms, Joerg; Gluehmann, Marco; Janell, Daniela; Bashan, Anat; Bartels, Heike; Agmon, Ilana (2000-09-01). "Structure of Functionally Activated Small Ribosomal Subunit at 3.3 Å Resolution". Cell. 102 (5): 615–623. doi:10.1016/S0092-8674(00)00084-2. PMID 11007480.
↑ Schluenzen, F.; Tocilj, A.; Zarivach, R.; Harms, J.; Gluehmann, M.; Janell, D.; Bashan, A.; Bartels, H.; Agmon, I. (2000-09-01). "Structure of functionally activated small ribosomal subunit at 3.3 angstroms resolution". Cell. 102 (5): 615–623. doi:10.1016/s0092-8674(00)00084-2. ISSN 0092-8674. PMID 11007480.
↑ Thompson, John F.; Hearst (1983). "Structure-Function Relations in E. coli 16s RNA" (PDF). Cell. 33 (1): 19–24. CiteSeerX 10.1.1.625.7760. doi:10.1016/0092-8674(83)90330-6. PMID 6380748.
↑ L Gold; D Pribnow; T Schneider; S Shinedling; B S Singer; Stormo, and G. (1981). "Translational Initiation in Prokaryotes". Annual Review of Microbiology. 35 (1): 365–403. doi:10.1146/annurev.mi.35.100181.002053. PMID 6170248.
↑ Tsiboli, Paraskevi; Herfurth, Elke; Choli, Theodora (1994-11-01). "Purification and Characterization of the 30S Ribosomal Proteins from the Bacterium Thermus thermophilus". European Journal of Biochemistry (به انگلیسی). 226 (1): 169–177. doi:10.1111/j.1432-1033.1994.0t169.x. ISSN 1432-1033. PMID 7957245.
↑ Choli T, Franceschi F, Yonath A, Wittmann-Liebold B (1993). "Isolation and characterization of a new ribosomal protein from the thermophilic eubacteria, Thermus thermophilus, T. aquaticus and T. flavus" (PDF). Biological Chemistry Hoppe-Seyler. 374 (6): 377–383. doi:10.1515/bchm3.1993.374.1-6.377. PMID 8357533.
↑ Schluenzen, Frank; Tocilj, Ante; Zarivach, Raz; Harms, Joerg; Gluehmann, Marco; Janell, Daniela; Bashan, Anat; Bartels, Heike; Agmon, Ilana (2000-09-01). "Structure of Functionally Activated Small Ribosomal Subunit at 3.3 Å Resolution". Cell. 102 (5): 615–623. doi:10.1016/S0092-8674(00)00084-2. PMID 11007480.
↑ ^۸٫۰ ^۸٫۱ ^۸٫۲ Brodersen, Ditlev E.; Clemons, William M.; Carter, Andrew P.; Morgan-Warren, Robert J.; Wimberly, Brian T.; Ramakrishnan, V. (2000-12-22). "The Structural Basis for the Action of the Antibiotics Tetracycline, Pactamycin, and Hygromycin B on the 30S Ribosomal Subunit". Cell. 103 (7): 1143–1154. doi:10.1016/S0092-8674(00)00216-6. PMID 11163189.
↑ Igarashi, Kazuei; Tanaka, Shigeaki; Kaji, Akira (1971-02-11). "On the aminoacyl-tRNA binding site of the 30-S ribosomal subunit and its relation to the chain initiation site of the ribosome". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Nucleic Acids and Protein Synthesis. 228 (3): 728–731. doi:10.1016/0005-2787(71)90737-4. PMID 4929429.

پیوند به بیرون

16S rRNA, BioMineWiki بایگانی‌شده در ۷ سپتامبر ۲۰۲۰ توسط Wayback Machine
http://pathmicro.med.sc.edu/mayer/antibiot.htm
16S Ribosomal RNA در سرعنوان‌های موضوعی پزشکی (MeSH) در کتابخانهٔ ملی پزشکی ایالات متحدهٔ آمریکا

[:02-1] Schluenzen, Frank; Tocilj, Ante; Zarivach, Raz; Harms, Joerg; Gluehmann, Marco; Janell, Daniela; Bashan, Anat; Bartels, Heike; Agmon, Ilana (2000-09-01). "Structure of Functionally Activated Small Ribosomal Subunit at 3.3 Å Resolution". Cell. 102 (5): 615–623. doi:10.1016/S0092-8674(00)00084-2. PMID 11007480.

[2] Schluenzen, F.; Tocilj, A.; Zarivach, R.; Harms, J.; Gluehmann, M.; Janell, D.; Bashan, A.; Bartels, H.; Agmon, I. (2000-09-01). "Structure of functionally activated small ribosomal subunit at 3.3 angstroms resolution". Cell. 102 (5): 615–623. doi:10.1016/s0092-8674(00)00084-2. ISSN 0092-8674. PMID 11007480.

[3] Thompson, John F.; Hearst (1983). "Structure-Function Relations in E. coli 16s RNA" (PDF). Cell. 33 (1): 19–24. CiteSeerX 10.1.1.625.7760. doi:10.1016/0092-8674(83)90330-6. PMID 6380748.

[4] L Gold; D Pribnow; T Schneider; S Shinedling; B S Singer; Stormo, and G. (1981). "Translational Initiation in Prokaryotes". Annual Review of Microbiology. 35 (1): 365–403. doi:10.1146/annurev.mi.35.100181.002053. PMID 6170248.

[5] Tsiboli, Paraskevi; Herfurth, Elke; Choli, Theodora (1994-11-01). "Purification and Characterization of the 30S Ribosomal Proteins from the Bacterium Thermus thermophilus". European Journal of Biochemistry (به انگلیسی). 226 (1): 169–177. doi:10.1111/j.1432-1033.1994.0t169.x. ISSN 1432-1033. PMID 7957245.

[pmid_8357533-6] Choli T, Franceschi F, Yonath A, Wittmann-Liebold B (1993). "Isolation and characterization of a new ribosomal protein from the thermophilic eubacteria, Thermus thermophilus, T. aquaticus and T. flavus" (PDF). Biological Chemistry Hoppe-Seyler. 374 (6): 377–383. doi:10.1515/bchm3.1993.374.1-6.377. PMID 8357533.

[:0-7] Schluenzen, Frank; Tocilj, Ante; Zarivach, Raz; Harms, Joerg; Gluehmann, Marco; Janell, Daniela; Bashan, Anat; Bartels, Heike; Agmon, Ilana (2000-09-01). "Structure of Functionally Activated Small Ribosomal Subunit at 3.3 Å Resolution". Cell. 102 (5): 615–623. doi:10.1016/S0092-8674(00)00084-2. PMID 11007480.

[:4-8] ۸٫۰ ^۸٫۱ ^۸٫۲ Brodersen, Ditlev E.; Clemons, William M.; Carter, Andrew P.; Morgan-Warren, Robert J.; Wimberly, Brian T.; Ramakrishnan, V. (2000-12-22). "The Structural Basis for the Action of the Antibiotics Tetracycline, Pactamycin, and Hygromycin B on the 30S Ribosomal Subunit". Cell. 103 (7): 1143–1154. doi:10.1016/S0092-8674(00)00216-6. PMID 11163189.

[:3-9] Igarashi, Kazuei; Tanaka, Shigeaki; Kaji, Akira (1971-02-11). "On the aminoacyl-tRNA binding site of the 30-S ribosomal subunit and its relation to the chain initiation site of the ribosome". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Nucleic Acids and Protein Synthesis. 228 (3): 728–731. doi:10.1016/0005-2787(71)90737-4. PMID 4929429.

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]

[۵]

[۶]

[۷]

[۸]

[۹]