آران‌ای ریبوزومی ۲۳اس
| آران‌ای ریبوزومی ۲۳اِس | |
|---|---|
 آران‌ای ریبوزومی ۲۳اس و ۵اس در زیرواحد ۵۰اس ریبوزومی | |
| Identifiers | |
| Other data | |
| آران‌ای type | ژن; rRNA |
| حوزه (زیست‌شناسی) | باکتری |
| SO | 0001263 |
| بانک داده پروتئین structures | PDBe |
آران‌ای ریبوزومی ۲۳اِس یک جزء ۲۹۰۴ نوکلئوتیدی (در اشریشیا کلی) زیرواحد ۵۰اس ریبوزوم پروکاریوتی است و مرکز پپتیدیل ترانسفراز (PTC) را تشکیل می‌دهد.[۲] این آران‌ای به شش دامنهٔ ساختاری ثانویه با عنوان I-VI تقسیم می‌شود که آران‌ای ریبوزومی ۵اس آن نیز دامنهٔ VII در نظر گرفته می‌شود.[۳] فعالیت ریبوزومی پپتیدیل ترانسفراز در دامنهٔ V این آران‌ای ریبوزومی قرار دارد، که همچنین رایج‌ترین محل اتصال آنتی‌بیوتیک‌هایی است که ترجمه را مهار می‌کنند و آن را به هدفی برای مهندسی ریبوزومی تبدیل می‌کند.[۲] یکی از اعضای شناخته‌شدهٔ این گروه آنتی‌بیوتیکی، کلرامفنیکل، با مهار تشکیل پیوند پپتیدی و بسته به گونهٔ ریبوزوم، دو محل اتصال متفاوت را مورد هدف قرار می‌دهد. جهش‌های متعدد در دامنه‌های آران‌ای ریبوزومی ۲۳اِس با فعالیت پپتیدیل ترانسفرازی منجر به مقاومت آنتی‌بیوتیکی شده‌است.[۳] ژن‌های آران‌ای ریبوزومی ۲۳اِس معمولاً تغییرات توالی بالاتری از جمله درج‌ها و/یا حذف‌هایی در مقایسه با سایر آران‌ای‌های ریبوزومی دارند.[۴]
همسان یوکاریوتی این زیرواحد در زیر واحد بزرگ ریبوزوم یوکاریوتی، آران‌ای ریبوزومی ۲۸اس است و دارای ناحیه‌ای است که با آران‌ای ریبوزومی ۵٫۸اس پر شده‌است.[۵]
عملکردها
[ویرایش]به‌طور کلی، آران‌ای ریبوزومی یک عملکرد اساسی پپتیدیل ترانسفرازی دارد. هستهٔ محرک ریبوزوم در پیکربندی پیوند پپتیدی نقش دارد. پپتیدیل-tRNA و آمینوآسیل-tRNA برای سنتز پروتئین مهم هستند.
در پلاست‌ها
[ویرایش]ریبوزوم‌های کلروپلاست از گیاهان «عالی» دارای یک آران‌ای ریبوزومی ۴٫۵اس اضافی هستند که با تکه‌تکه شدن ۲۳اس ایجاد می‌شود. در سمت ۳' و ۲۳اس در اپرون آران‌ای قرار دارد و مربوط به انتهای ۳' زیرواحد ریبوزومی غیر تکه‌تکه شده‌است.[۶]
جستارهای وابسته
[ویرایش]منابع
[ویرایش]- ↑ Mueller F, Sommer I, Baranov P, Matadeen R, Stoldt M, Wöhnert J, Görlach M, van Heel M, Brimacombe R (2000). "The 3D arrangement of the 23 S and 5 S rRNA in the Escherichia coli 50 S ribosomal subunit based on a cryo-electron microscopic reconstruction at 7.5 Å resolution". J Mol Biol. 298 (1): 35–59. doi:10.1006/jmbi.2000.3635. PMID 10756104.
- ↑ ۲٫۰ ۲٫۱ Walker, Allison S.; Russ, William P.; Ranganathan, Rama; Schepartz, Alanna (2020-08-18). "RNA sectors and allosteric function within the ribosome". Proceedings of the National Academy of Sciences (به انگلیسی). 117 (33): 19879–19887. doi:10.1073/pnas.1909634117. ISSN 0027-8424. PMC 7443888. PMID 32747536.
- ↑ ۳٫۰ ۳٫۱ Zerges, William; Hauser, Charles (2009-01-01), Harris, Elizabeth H.; Stern, David B.; Witman, George B. (eds.), "Chapter 28 - Protein Synthesis in the Chloroplast", The Chlamydomonas Sourcebook (Second Edition) (به انگلیسی), London: Academic Press: 967–1025, ISBN 978-0-12-370873-1, retrieved 2021-10-07
- ↑ Pei, Anna; Nossa, Carlos W.; Chokshi, Pooja; Blaser, Martin J.; Yang, Liying; Rosmarin, David M.; Pei, Zhiheng (5 May 2009). "Diversity of 23S rRNA Genes within Individual Prokaryotic Genomes". PLOS ONE. 4 (5): e5437. Bibcode:2009PLoSO...4.5437P. doi:10.1371/journal.pone.0005437. PMC 2672173. PMID 19415112.
- ↑ Doris, Stephen M.; Smith, Deborah R.; Beamesderfer, Julia N.; Raphael, Benjamin J.; Nathanson, Judith A.; Gerbi, Susan A. (October 2015). "Universal and domain-specific sequences in 23S–28S ribosomal RNA identified by computational phylogenetics". RNA. 21 (10): 1719–1730. doi:10.1261/rna.051144.115. PMC 4574749. PMID 26283689.
- ↑ Bieri, P; Leibundgut, M; Saurer, M; Boehringer, D; Ban, N (15 February 2017). "The complete structure of the chloroplast 70S ribosome in complex with translation factor pY". The EMBO Journal. 36 (4): 475–486. doi:10.15252/embj.201695959. PMC 5694952. PMID 28007896.