گرومکس

گرومکس (Gromacs): ماشین گرونینگن برای شبیه‌سازی‌های شیمیایی (Groningen Machine for Chemical Simulations)

گرومکس یک مجموعه دینامیک مولکولی است که عمدتاً برای شبیه‌سازی پروتئین‌ها، چربی‌ها و اسیدهای نوکلئیک طراحی شده است. در ابتدا در گروه شیمی فیزیک دانشگاه گرونینگن پایه‌گذاری شد و در حال حاضر توسط همکاران در دانشگاه‌ها و مراکز تحقیقاتی سراسر جهان در حال توسعه است.[۲][۱] گرومکس یکی از سریع‌ترین و محبوب‌ترین بسته‌های نرم‌افزاری موجود است. این نرم‌افزار می‌تواند روی واحد پردازش مرکزی (CPU) و واحد پردازش گرافیکی (GPU)اجرا شود. گرومکس یک نرم‌افزار متن باز رایگان است که تحت مجوز عمومی همگانی گنو (GPL) منتشر شده است و شروع آن با نسخه ۴٫۶ تحت مجوز کمتر فراگیر همگانی گنو (LGPL)بوده است.

منابع

1. "People — Gromacs". gromacs.org. 14 March 2012. Retrieved 2۶ ژوئن ۲۰۱۲

2. Van Der Spoel D, Lindahl E, Hess B, Groenhof G, Mark AE, Berendsen HJ (2005). "GROMACS: fast, flexible, and free". J Comput Chem. 26 (16): 1701–18. PMID 16211538. doi:10.1002/jcc.۲۰۲۹۱