فهرست مدلهای شبیهسازی کووید-۱۹
ظاهر
توجه داشته باشید که برخی از برنامههای ذکر شده فقط مدلها یا شبیهسازهای وبگاهی هستند و برخی از آنها به دادههای بیدرنگ منابع دیگر اعتماد دارند (یا از آنها استفاده میکنند).
مدلهایی با بیشترین پشتوانه علمی[ویرایش]
لیست فرعی شامل شبیهسازهایی است که براساس مدلهای نظری ساخته شدهاند. با توجه به تعداد بالای تحقیقات پیش از چاپ ایجاد و راهاندازی شده توسط دنیاگیری کوید-۱۹،[۱] مخصوصاً مدلهای جدیدتر فقط باید با موشکافی علمی بیشتری در نظر گرفته شوند.[۲][۳][۴]
شبیهسازیها و مدلها[ویرایش]
- چن و همکاران شبیهسازی بر اساس مدل Bats-Hosts-Reservoir-People (BHRP) (فقط به RP ساده شدهاست)[۵]
- کوسیم۱۹[۶] - پروفسور لهر، بر اساس مدل SEIRD
- مدل تحرک کووید-۱۹[۷] - استنفورد براساس مدل SEIR[۸]
- شبیهساز کووید-۱۹[۹] - دانشکده پزشکی هاروارد بر اساس مدل پویایی سامانه (محفظهای) معتبر[۱۰]
- کووید-۱۹ ساج[۱۱] - سیدیسی[۱۲]
- کوویدسیم[۱۳] - توسط مارک کوک یو نگ و دیگران.
- کوویدسیم - کالج امپریال لندن، امآرسی مرکز تجزیه و تحلیل بیماریهای عفونی جهانی و نیل فرگوسن و همکاران.
- کوویدسیم[۱۴] - پروژه تحقیقاتی دانشگاه علمی کاربردی مونیخ، پروفسور کوستر
- کوویدسیم[۱۵] - نوشته شده در متلب[۱۶] توسط Ng و Gui[۱۷]
- CovidSIM.eu[۱۸] - مارتین آیچنر، مارکوس شوهم با حمایت دانشگاه توبینگن و تحت حمایت وزارت آموزش و تحقیقات فدرال آلمان.[۱۹]
- کوویدسیم[۲۰] - اشنایدر و همکاران
- کوورادار[۲۱] - برای نظارت مولکولی پروتئین اسپایک کرونا[۲۲][۲۳]
- مدل دکتر غفارزادگان[۲۴][۲۵][۲۶]
- اونت هوریزون - کووید-۱۹[۲۷] - اچیو برلین براساس مدل SIR-X[۲۸]
- اِیآی تکاملی[۲۹] - «مداخلات غیر دارویی (NPIs) که اِیآی با گذشت زمان برای کشورها و مناطق مختلف ایجاد میکند، اثر پیشبینی شده آنها.»[۳۰][۳۱][۳۲]
- مدل آیاچامئی - مؤسسه سنجش و معیارهای سلامت مدل کووید
- OxCGRT[۳۳] - رهگیری پاسخ دولت آکسفورد کووید-۱۹[۳۴][۳۲]
- اسسی-کاسمو[۳۵] - مدل شبیهسازی ویروس کرونا استنفورد-SECIR[۳۶][۳۷][۳۸][۳۹] - مدلی از مرکز تحقیقات عفونت هلمهولتز
- سرمایهگذاری هوشمند منابع آزمایش آرانای ویروس برای بهسازی کاهش اثرکووید-۱۹[۴۰][۴۱]
- مجموعه اپیدمیولوژی SIAM[۴۲]
- مدل کووید یویانگ چییو
پایگاهداده ژنوم[ویرایش]
چندین مورد از این مدلها از پایگاه دادههای ژنوم استفاده میکنند، از جمله موارد زیر:
- بانک دادهٔ دیانای ژاپن
- بایگانی نوکلئوتید اروپا
- جییآیاسایآیدی
- نسبتدهی تبارشناختی از تبارهای شیوع جهانی نامگذاری شده
کنسرسیوم، خوشههای تحقیق، مجموعههای دیگر[ویرایش]
- لیست سیدیسی شامل پیشبینی و فرضیات[۴۳] - فهرست بزرگ با مدلهای مختلف و غیره
- CORSMA - کنسرسیوم اتحادیه اروپا (کووید-۱۹-شیوع پاسخ ترکیبی از سلامت الکترونیکی، سرولوژی، مدلسازی، هوش مصنوعی و تحقیقات پیادهسازی)[۴۴]
- مرکز پیشبینی کووید-۱۹[۴۵] - به عنوان مخزن مرکزی پیشبینیها و پیشگوییهای بیش از ۵۰ گروه تحقیقاتی بینالمللی عمل میکند.[۴۶][۴۷]
- نکساسنرین - پروژه منبع باز برای استفاده از توان علمی و بهداشت عمومی دادههای ژنوم پاتوژن[۴۸]
- همچنین به منابع نکساسترین سارس-کوو-۲ مراجعه کنید[۴۹]
- اسآیامآیدی[۵۰] - مدلهای شبیهسازی بیماریهای عفونی - کنسرسیوم تحقیقاتی بلژیک
- آرایامپی - کمک سریع در مدلسازی موارد دنیاگیری[۵۱] (انگلستان)
- کنسرسیوم مدلسازی UT Austin کووید-۱۹[۵۲]
نمایشگرها، مدلها یا پیشخوانهای واکسیناسیون[ویرایش]
- کووید-۱۹ داشبورد[۵۳] - مرکز علوم و مهندسی سیستمها (CSSE) در دانشگاه جان هاپکینز (JHU)[۵۴][۵۵]
- دیتاهاب کروناویروس جدید ۲۰۱۹ مجموعهداده[۵۶][۵۷] - مجموعهدادهٔ کووید-۱۹ بیماری کوروناویروس ۲۰۱۹ (کوید-۱۹) در سریهای زمانی موارد تأیید شده، مرگ و میر گزارش شده و بهبودی گزارش شده.
- Impfdashboard.de - مانیتور واکسیناسیون آلمان[۵۸]
- شبیهسازی کمپینواکسیناسیون-کووید ۱۹[۵۹] - نظارت بر فعالیت واکسیناسیون در آلمان توسط آزمایشگاه Zi Science Science
- پیشبینیهای مؤسسه سنجش و ارزیابی سلامت (IHME) کووید-۱۹[۶۰]
- همچنین به مدل کووید مؤسسه سنجش و ارزیابی بهداشت مراجعه کنید
مدلهایی که پشتوانه علمی کمتری دارند[ویرایش]
مدلهای زیر فقط برای اهداف آموزشی است.
- شبیهساز کووید-۱۹[۶۱]
- کووید۱۹: ۷ مورد برتر - فهرست برگزیده[۶۲] در مدیوم ارسال شدهاست[۶۳]
- github.com/ موضوعات: کووید-۱۹[۶۴]
- شبیهساز آیاسئیئی سیستمز کوید-۱۹[۶۵]
- nCoV2019.live[۶۶] - «اعدادی که با یک نگاه سریع به آنها نیاز دارید» توسط شیفمن / کانلون
- cov19.cc- توسط کانلون[۶۷]
- سیمول۸ - منابع شبیهسازی کووید-۱۹[۶۸]
- شبیهسازی ویروس کرونا با مدل SIR[۶۹]
- شبیهسازی گسترش ویروس[۷۰]
سایر شبیهسازیها، مدلها یا منابع داده مرتبط[ویرایش]
- (انجمن شیمی آمریکا) جستجوگر نشانگر زیستی کووید-۱۹ سیایاس (به انگلیسی: CAS COVID-19 BIOINDICATOR EXPLORER)[۷۱]
- ردیاب داده کووید سیدیسی[۷۲]
- شرکای جامعه مدنی در همبستگی علیه کووید-۱۹ (CSPAC): گزارش وضعیت کامل، زنده، جهانی، کووید-۱۹ برای ۲۵۱ منطقه و ۷۱ کشتی[۷۳]
- مؤسسه تحقیقات اجتماعی و اقتصادی کرنل (CISER): منابع داده کووید-۱۹[۷۴]
- مدلسازی چند فاز اولری - لاگرانژی، به عنوان مثال برای انتقال کووید-۱۹ در آسانسورها بر اساس سیافدی[۷۵]
- ویروس کرونا منبع داده دنیای ما درداده[۷۶]
- پروژه رهگیری کووید ۱۹ اقیانوس اطلس[۷۷]
- ودر (به انگلیسی: Vadere) - چارچوبی منبع باز برای شبیهسازی عابرپیاده و جمعیت[۷۸]
- داشبورد هو کروناویروس (کووید-۱۹)[۷۹]
یادگیریها و منابع دیگر[ویرایش]
- تخصص مدلسازی بیماریهای عفونی - ارائه شده در Coursera توسط کالج امپریال لندن
- معرفی جعبه ابزار شبیهسازی و یادگیری ماشین کووید-۱۹ برای پیشبینی گسترش کووید-۱۹ - وبلاگ یادگیری ماشین AWS
جستارهای وابسته[ویرایش]
- مدل SIR
- شبیهسازی رایانهای
- شبیهسازی در بهداشت و درمان
- مدلسازی ریاضی بیماری عفونی
- زیستشناسی محاسباتی
- بیوانفورماتیک
منابع[ویرایش]
- ↑ Brierley L. "The role of research preprints in the academic response to the COVID-19 epidemic" (به انگلیسی). doi:10.22541/au.158516578.89167184.
{{cite journal}}
: Cite journal requires|journal=
(help) - ↑ "Another 178,000 deaths? Scientists' latest virus projection is a warning". NBC News (به انگلیسی). Retrieved 2021-02-22.
- ↑ "Don't Believe the COVID-19 Models". The Atlantic (به انگلیسی). 2020-04-02. Retrieved 2021-02-22.
- ↑ "Epidemic Modeling 102: All CoVID-19 models are wrong, but some are useful". Medium (به انگلیسی). 2020-09-09. Retrieved 2021-02-22.
- ↑ Chen TM, Rui J, Wang QP, Zhao ZY, Cui JA, Yin L (February 2020). "A mathematical model for simulating the phase-based transmissibility of a novel coronavirus". Infectious Diseases of Poverty. 9 (1): 24. doi:10.1186/s40249-020-00640-3. PMC 7047374. PMID 32111262.
- ↑ CoSim19 shiny.covid-simulator.com
- ↑ COVID-19 MOBILITY MODELING covid-mobility.stanford.edu
- ↑ Chang S, Pierson E, Koh PW, Gerardin J, Redbird B, Grusky D, Leskovec J (January 2021). "Mobility network models of COVID-19 explain inequities and inform reopening". Nature. 589 (7840): 82–87. Bibcode:2021Natur.589...82C. doi:10.1038/s41586-020-2923-3. PMID 33171481.
- ↑ COVID-19 Simulator covid19sim.org
- ↑ "Policy Simulator Methodology". COVID-19 Simulator (به انگلیسی). Retrieved 2021-02-21.
- ↑ COVID-19 Surge www.cdc.gov
- ↑ CDC (2020-02-11). "Healthcare Workers". Centers for Disease Control and Prevention (به انگلیسی). Retrieved 2021-02-22.
- ↑ COVIDSIM www.markusng.com
- ↑ CovidSim www.hm.edu
- ↑ COVIDSim github.com/nkymark
- ↑ nkymark/COVIDSim, 2020-12-23, retrieved 2021-03-09
- ↑ Ng KY, Gui MM (October 2020). "COVID-19: Development of a robust mathematical model and simulation package with consideration for ageing population and time delay for control action and resusceptibility". Physica D. Nonlinear Phenomena. 411: 132599. Bibcode:2020PhyD..41132599N. doi:10.1016/j.physd.2020.132599. PMC 7282799. PMID 32536738.
- ↑ CovidSIM.eu covidsim.eu
- ↑ "CovidSIM". covidsim.eu. Retrieved 2021-03-13.
- ↑ Schneider KA, Ngwa GA, Schwehm M, Eichner L, Eichner M (November 2020). "The COVID-19 pandemic preparedness simulation tool: CovidSIM". BMC Infectious Diseases. 20 (1): 859. doi:10.1186/s12879-020-05566-7. PMC 7675392. PMID 33213360.
- ↑ CovRadar covradar.net
- ↑ الگو:Cite biorxiv
- ↑ "Molecular surveillance of SARS-CoV-2 spike protein mutations using CovRadar". News-Medical.net (به انگلیسی). 2021-02-07. Retrieved 2021-04-25.
- ↑ "Dr. Ghaffarzadegan's model - Simulate your university's covid-19 cases". forio.com. Retrieved 2 May 2021.
- ↑ Ghaffarzadegan N (2021-02-01). "Simulation-based what-if analysis for controlling the spread of Covid-19 in universities". PLOS ONE. 16 (2): e0246323. doi:10.1371/journal.pone.0246323. PMC 7850497. PMID 33524045.
- ↑ "COVID-19 simulation model creates scenarios". www.vtnews.vt.edu (به انگلیسی). Archived from the original on 6 March 2021. Retrieved 2021-02-21.
- ↑ Event Horizon - COVID-19 rocs.hu-berlin.de
- ↑ Maier BF, Brockmann D (May 2020). "Effective containment explains subexponential growth in recent confirmed COVID-19 cases in China". Science. 368 (6492): 742–746. Bibcode:2020Sci...368..742M. doi:10.1126/science.abb4557. PMC 7164388. PMID 32269067.
- ↑ Evolutionary AI evolution.ml
- ↑ "Evolutionary AI". evolution.ml. Retrieved 2021-04-26.
- ↑ A bot will complete this citation soon. Click here to jump the queue arXiv:[۱].
- ↑ ۳۲٫۰ ۳۲٫۱ "Can Computer Models Select the Best Public Health Interventions for COVID-19?". IEEE Spectrum: Technology, Engineering, and Science News (به انگلیسی). Retrieved 2021-04-26.
- ↑ OxCGRT www.bsg.ox.ac.uk
- ↑ "COVID-19 Government Response Tracker". www.bsg.ox.ac.uk (به انگلیسی). Retrieved 2021-04-26.
- ↑ SC-COSMO www.sc-cosmo.org
- ↑ Khailaie, Sahamoddin; Mitra, Tanmay; Bandyopadhyay, Arnab; Schips, Marta; Mascheroni, Pietro; Vanella, Patrizio; Lange, Berit; Binder, Sebastian; Meyer-Hermann, Michael (2020-04-07). "Estimate of the development of the epidemic reproduction number Rt from Coronavirus SARS-CoV-2 case data and implications for political measures based on prognostics". medRxiv (به انگلیسی): 2020.04.04.20053637. doi:10.1101/2020.04.04.20053637.
{{cite journal}}
:|hdl-access=
requires|hdl=
(help) - ↑ "simm / covid19 / SECIR". GitLab (به انگلیسی). Retrieved 2021-07-05.
- ↑ "Report · Wiki · simm / covid19 / SECIR". GitLab (به انگلیسی). Retrieved 2021-07-05.
- ↑ "Our research". Helmholtz Centre for Infection Research (به انگلیسی). Retrieved 2021-07-05.
- ↑ - Smart Investment of Virus RNA Testing Resources to Enhance Covid-19 Mitigationcorona-lab.ch, accessed 28 April 2021
- ↑ Gorji H, Arnoldini M, Jenny DF, Hardt WD, Jenny P (2020-12-02). "Smart Investment of Virus RNA Testing Resources to Enhance Covid-19 Mitigation" (به انگلیسی). doi:10.1101/2020.11.30.20239566.
{{cite journal}}
: Cite journal requires|journal=
(help) - ↑ Epidemiology Collection epubs.siam.org
- ↑ CDC list of Forecast Inclusion and Assumptions www.cdc.gov
- ↑ "CORESMA". CORESMA (به انگلیسی). Retrieved 2021-07-05.
- ↑ COVID-19 Forecast Hub
- ↑ "Where The Latest COVID-19 Models Think We're Headed — And Why They Disagree". FiveThirtyEight (به انگلیسی). 2020-05-01. Retrieved 2021-02-21.
- ↑ "Home - COVID 19 forecast hub". covid19forecasthub.org (به انگلیسی). Retrieved 2021-02-21.
- ↑ "Nextstrain". nextstrain.org (به انگلیسی). Retrieved 2021-04-26.
- ↑ Nextstrain SARS-CoV-2 resources nextstrain.org/sars-cov-2
- ↑ SIMID www.simid.be
- ↑ "Rapid Assistance in Modelling the Pandemic: RAMP | Royal Society". royalsociety.org (به انگلیسی). Retrieved 2021-03-09.
- ↑ UT Austin COVID-19 Modeling Consortium covid-19.tacc.utexas.edu
- ↑ COVID-19 Dashboard coronavirus.jhu.edu
- ↑ "COVID-19 Map". Johns Hopkins Coronavirus Resource Center (به انگلیسی). Retrieved 2021-04-26.
- ↑ Dong, Ensheng; Du, Hongru; Gardner, Lauren (2020-05-01). "An interactive web-based dashboard to track COVID-19 in real time". The Lancet Infectious Diseases (به انگلیسی). 20 (5): 533–534. doi:10.1016/S1473-3099(20)30120-1. ISSN 1473-3099. PMC 7159018. PMID 32087114.
- ↑ Datopian; Open Knowledge International. "Novel Coronavirus 2019". DataHub.io (به انگلیسی). Retrieved 2021-05-02.
- ↑ datasets/covid-19, Data Packaged Core Datasets at GitHub, 2021-05-02, retrieved 2021-05-02
- ↑ Gesundheit, Bundesministerium für. "Das offizielle Dashboard zur Impfkampagne der Bundesrepublik Deutschland". impfdashboard.de (به آلمانی). Retrieved 2021-06-07.
- ↑ Simulation der COVID19-Impfkampagne
- ↑ COVID-19 Projections covid19.healthdata.org
- ↑ Covid-19 Simulator www.coronasimulator.com, accessed 28 April 2021
- ↑ COVID19: Top 7 - A curated list towardsdatascience.com
- ↑ "COVID19: Top 7 online interactive simulations, curated". Medium (به انگلیسی). 2020-05-03. Retrieved 2021-02-21.
- ↑ covid-19 github.com/topics
- ↑ COVID-19 Simulator exchange.iseesystems.com
- ↑ nCoV2019.live ncov2019.live
- ↑ cov19.cc
- ↑ "COVID-19 Simulation Resources". Retrieved 2020-02-21.
- ↑ Simulating coronavirus with the SIR model بایگانیشده در ۱۹ آوریل ۲۰۲۱ توسط Wayback Machine fatiherikli.github.io
- ↑ Virus Spread Simulation c19model.com
- ↑ "CAS COVID-19 Resources". CAS (به انگلیسی). Retrieved 2021-06-02.
- ↑ COVID Data Tracker covid.cdc.gov
- ↑ "Full, live, global, COVID-19 Status Report for 251 locales & 71 Ships". civilsocietysolidarityagainstcovid19.com (به انگلیسی). Retrieved 2021-07-01.
- ↑ COVID-19 Data Sources guides.library.cornell.edu
- ↑ Dbouk T, Drikakis D (January 2021). "On airborne virus transmission in elevators and confined spaces". Physics of Fluids. 33 (1): 011905. Bibcode:2021PhFl...33a1905D. doi:10.1063/5.0038180. PMC 7984422. PMID 33790526.
- ↑ Coronavirus Source Data ourworldindata.org
- ↑ COVID 19 Tracking Project covidtracking.com
- ↑ Vadere - Open Source Framework for Pedestrian and Crowd Simulation www.vadere.org
- ↑ "WHO Coronavirus (COVID-19) Dashboard". covid19.who.int (به انگلیسی). Retrieved 2021-07-01.
برای مطالعه بیشتر[ویرایش]
مقالات[ویرایش]
- Adam D (April 2020). "Special report: The simulations driving the world's response to COVID-19". Nature. 580 (7803): 316–318. Bibcode:2020Natur.580..316A. doi:10.1038/d41586-020-01003-6. PMID 32242115. S2CID 214771531.
- Alper J. "WXML 2020 covid-modeling learning guide". Department of Mathematics. Seattle, Washington: University of Washington.
- Fuller J (March 2021). "What are the COVID-19 models modeling (philosophically speaking)?". History and Philosophy of the Life Sciences. 43 (2): 47. doi:10.1007/s40656-021-00407-5. PMC 7994354. PMID 33770267.
- Roberts M, Driggs D, Selby I, Sala E, Schönlieb CB (1 June 2021). "Fighting a Pandemic with Medical Imaging and Machine Learning: Lessons Learned from COVID-19". SIAM News.
کتابها[ویرایش]
- Basavarajaiah D, Murthy BN (2022-04-25). COVID Transmission Modeling: An Insight into Infectious Diseases Mechanism (1 ed.). Boca Raton: Chapman and Hall/CRC. ISBN 978-1-00-320479-4. Retrieved 2022-07-23.
- Prabha S, Karthikeyan P, Kamalanand K, Selvaganesan N (7 July 2021). Computational Modelling and Imaging for SARS-CoV-2 and COVID-19 (1st ed.). CRC Press. doi:10.1201/9781003142584. ISBN 978-1-00-314258-4. S2CID 237802484.
- Azar AT, Hassanien AE, eds. (2022). Modeling, Control and Drug Development for COVID-19 Outbreak Prevention. Studies in Systems, Decision and Control. Vol. 366. Cham: Springer International Publishing. doi:10.1007/978-3-030-72834-2. ISBN 978-3-030-72833-5. S2CID 240429840. Retrieved 2022-07-23.
- Pani SK, Dash S, dos Santos WP, Bukhari SA, Flammini F, eds. (2022). Assessing COVID-19 and Other Pandemics and Epidemics using Computational Modelling and Data Analysis. Cham: Springer International Publishing. doi:10.1007/978-3-030-79753-9. ISBN 978-3-030-79752-2. S2CID 245119014.
- Martcheva, Maia (2015). An Introduction to Mathematical Epidemiology. Texts in Applied Mathematics. Vol. 61. Boston, MA: Springer US. doi:10.1007/978-1-4899-7612-3. ISBN 978-1-4899-7611-6. Retrieved 2022-09-12.
- Li, Michael Y. (2018). An Introduction to Mathematical Modeling of Infectious Diseases. Cham: Springer International Publishing. doi:10.1007/978-3-319-72122-4. ISBN 978-3-319-72121-7. Retrieved 2022-09-12.