درج‌حذف‌های امضای حفظ‌شده
درج‌حذف‌های امضای حفظ‌شده (به انگلیسی: Conserved signature indels)، در توالی‌های پروتئینی دسته مهمی از نشانگرهای مولکولی را برای درک روابط تبارزایی فراهم می‌کنند.[۱][۲] آنها توسط تغییرهای ژنتیکی نادر ایجاد می‌شوند، نشانگرهای تبارزایی سودمندی را ارائه می‌دهند که عموماً اندازه مشخصی دارند و برای اطمینان از قابلیت اطمینان آنها از دو سو توسط مناطق حفظ‌شده دربر گرفته شده‌اند. در حالی که ایندل‌ها می‌توانند درج یا حذف دلخواه باشند، درج‌حذف‌های امضای حفظ‌شده تنها به عنوان آن دسته از درج‌حذف‌های پروتئینی تعریف می‌شوند که در مناطق حفظ‌شده پروتئین وجود دارند.[۲][۳][۴][۵]
منابع
[ویرایش]- ↑ Baldauf, S. L. (1993). "Animals and Fungi are Each Other's Closest Relatives: Congruent Evidence from Multiple Proteins". Proceedings of the National Academy of Sciences. 90 (24): 11558–11562. Bibcode:1993PNAS...9011558B. doi:10.1073/pnas.90.24.11558. PMC 48023. PMID 8265589.
- ↑ ۲٫۰ ۲٫۱ Gupta, Radhey S. (1998). "Protein Phylogenies and Signature Sequences: A Reappraisal of Evolutionary Relationships among Archaebacteria, Eubacteria, and Eukaryotes". Microbiology and Molecular Biology Reviews. 62 (4): 1435–91. doi:10.1128/MMBR.62.4.1435-1491.1998. PMC 98952. PMID 9841678.
- ↑ Gupta, Radhey S.; Griffiths, Emma (2002). "Critical Issues in Bacterial Phylogeny". Theoretical Population Biology. 61 (4): 423–34. doi:10.1006/tpbi.2002.1589. PMID 12167362.
- ↑ Cutiño-Jiménez, Ania M.; Martins-Pinheiro, Marinalva; Lima, Wanessa C.; Martín-Tornet, Alexander; Morales, Osleidys G.; Menck, Carlos F.M. (2010). "Evolutionary placement of Xanthomonadales based on conserved protein signature sequences". Molecular Phylogenetics and Evolution. 54 (2): 524–34. doi:10.1016/j.ympev.2009.09.026. PMID 19786109.
- ↑ Rokas, Antonis; Holland, Peter W.H. (2000). "Rare genomic changes as a tool for phylogenetics". Trends in Ecology & Evolution. 15 (11): 454–459. doi:10.1016/S0169-5347(00)01967-4. PMID 11050348.