این تصویر (یا تمام تصاویر این مقاله یا رده) بااینکه شامل دادههای غیرعکسبرداریشده هستند، در قالب (فرمت) جیپیئیجی/JPEGبارگذاری شدهاند، اما، آن(ها) شامل اطلاعاتی میباشد که میتوانست با کارایی مناسبتری و دقیقتر در قالب پیانجی/PNG یااسویجی/SVG ذخیره شود. درصورت امکان، لطفاً نسخه PNG یا SVG این تصویر را بدون آسیبهای حاصل از فشرده سازی با استفاده از منبعی غیر-JPEG (یا با حذف آسیبها از تصویر کنونی) بارگذاری کنید، سپس، لطفاً نسخهٔ جیپیئیجی را با {{Superseded|NewImage.ext}} برچسپ بزنید و این پرچسپ را حذف کنید، برای کسب اطلاعات بیشتر {{BadJPEG}} را ببینید.
خلاصه
توضیح1-s2.0-S0006291X20320593-gr3 lrg.jpg
English: Phylogeny and pp1ab domain organization of selected nidoviruses. Representatives of 13 lineages of nidoviruses that infect vertebrates (three virus families) and invertebrates (two virus families) are depicted. Names of taxa, families and genera, are indicated in grey italic font, and names of viruses are given as acronyms: EAV, equine arteritis virus; SHFV, simian hemorrhagic fever virus; LDV, lactate dehydrogenase-elevating virus; PRRSV, porcine reproduction respiratory syndrome virus; BRV, Breda virus; WBV, white bream virus; "BPNV, ball python nidovirus;" TGEV, porcine transmissible gastroenteritis virus; MHV, mouse hepatitis virus; BuCoV_HKU11, bulbul coronavirus HKU11; IBV, avian infectious bronchitis virus; NDiV, Nam Dinh virus; GAV, gill-associated virus. Midpoint rooted phylogeny was reconstructed based on Viralis multiple sequence alignment [92] of the conserved core of RdRp, using IQ-Tree 1.5.5 [93] with automatically selected the rtREV + F + I + G4 evolutionary model. To estimate branch support, SH-like approximate likelihood ratio test with 1000 replicates was conducted. Polyproteins pp1ab are shown as light grey bars; they are autoproteolytically processed to nsps that were identified only for few nidoviruses and omitted here (see also Fig. 1). TM domains are shown as dark grey bars; TM helices were predicted by TMHMM2.0c [94] and clustered if separated by less than 300 aa (less than 180 aa for arteri- and tobaniviruses). Other selected domains, whose coordinates were obtained from the Viralis database [92], are shown as colored bars; proteolytically inactive PLP domains are indicated by stripes on bars; indices of PLP domains are specified below the bars. "Pkinase, protein kinase [25]; CPD, cyclic phosphodiestarase known also as 2′,5′-phosphodiesterase, 2′PDE [58,95]; NADAR, domain involved in the utilization of NAD and ADP-ribose derivatives [96]; for other domains, see Fig. 1 in the source.
تاریخ
منبع
Anastasia A. Gulyaeva, Alexander E. Gorbalenya, A nidovirus perspective on SARS-CoV-2, Biochemical and Biophysical Research Communications, Volume 538, 2021, Pages 24-34, ISSN 0006-291X,
برای به اشتراک گذاشتن – برای کپی، توزیع و انتقال اثر
تلفیق کردن – برای انطباق اثر
تحت شرایط زیر:
انتساب – شما باید اعتبار مربوطه را به دست آورید، پیوندی به مجوز ارائه دهید و نشان دهید که آیا تغییرات ایجاد شدهاند یا خیر. شما ممکن است این کار را به هر روش منطقی انجام دهید، اما نه به هر شیوهای که پیشنهاد میکند که مجوزدهنده از شما یا استفادهتان حمایت کند.
https://creativecommons.org/licenses/by/4.0CC BY 4.0 Creative Commons Attribution 4.0 truetrue
عنوان
شرحی یکخطی از محتوای این فایل اضافه کنید
Phylogeny and pp1ab domain organization of selected nidoviruses.
Uploaded a work by Anastasia A.Gulyaeva and Alexander E.Gorbalenya from Anastasia A. Gulyaeva, Alexander E. Gorbalenya, A nidovirus perspective on SARS-CoV-2, Biochemical and Biophysical Research Communications, Volume 538, 2021, Pages 24-34, ISSN 0006-291X, https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2020.11.015 with UploadWizard
این پرونده حاوی اطلاعات اضافهایست که احتمالاً دوربین دیجیتال یا پویشگری که در ایجاد یا دیجیتالی کردن آن به کار رفته آن را افزوده است. اگر پرونده از وضعیت ابتداییاش تغییر داده شده باشد آنگاه ممکن است شرح و تفصیلات موجود اطلاعات تصویر را تماماً بازتاب ندهد.